In Buenos Aires in eine spanischstämmige Familie hineingeboren, machte er sich schon in jungen Jahren als virtuoser Gitarrist einen Namen, so dass er im Alter von 19 Jahren zum ersten Mal durch Südamerika tourte und begeisterte Kritiken erhielt. Vier Jahre später gewann er den ersten Preis und die Goldmedaille beim jährlichen argentinischen Interpretationswettbewerb.
1962 zog er nach Madrid, um dem großen Maestro Narciso Yepes zu folgen, und begann sofort, zahlreiche Konzerte in ganz Spanien zu geben. Ab 1965 vervollkommnete er seine Studien der Alten Musik und widmete sich leidenschaftlich der Erforschung und Verbreitung des Werks der spanischen Vihuelisten, wobei er die Vihuela und die Laute zu seinen Konzertinstrumenten machte. 1968 gründete er zusammen mit Mariano Martín und Marcial Moreiras die Gruppe LEMA “Labor and Style in Early Music”, der sich später die argentinische Sopranistin Matilde Pérez Berlanga anschloss, mit der er wichtige Schallplattenproduktionen realisieren sollte. Er war Leiter der Abteilung für Alte Musik am Instituto Psicopedagógico de las Artes de Madrid.
Zwischen 1973 und 1974 veröffentlichte Fresno mehrere Bände der Antología de los vihuelistas españoles (Anthologie der spanischen Vihuelisten: Werke für Vihuela, Renaissance-Laute und Gitarre). Sein ausgeprägtes Interesse an der Alten Musik, das Studium verschiedener Traktate und eine profunde Kenntnis dieser Musik haben ihn zu einem der ersten Interpreten der spanischen und europäischen Musik des 16. und 19. Jahrhunderts gemacht, der historische Instrumente (Vihuela, Laute, Theorbe, Barockgitarre und romantische Gitarre) verwendet und Technik und Stil der verschiedenen Epochen anwendet.
Er wurde zu den großen internationalen Musikfestivals in Amsterdam, Berlin, Weilburg, Frankfurt, Siena, Mailand, Florenz, Belgrad, Saintes, Estella, Madrid, Barcelona und Santander eingeladen. Er hat für das niederländische, spanische, schweizerische und italienische Fernsehen sowie für Radio RIAS in Berlin, Hilvesum in Holland, Radio France, Radio Suiza, RAI und Radio Nacional in Spanien aufgenommen.
Zusammen mit der Schweizer Sopranistin Rosa Maria MeisterJorge Fresno gründete die internationale Gruppe in Bern (1978). Albicastro Ensemble für das Studium und die Verbreitung alter spanischer, italienischer und deutscher Musik, zu dem er zu den wichtigsten Fachfestivals eingeladen wurde und mit dem er zahlreiche Uraufführungen realisiert hat.
Jorge Fresno hat sich um die Wiederentdeckung und Verbreitung der Musik von Gaspar Sanz verdient gemacht. Dies gipfelte in der weltweit ersten Gesamteinspielung seiner Werke für Barockgitarre, die von Fresno für die Ausstellung in Sevilla 1992 im Pavillon von Aragon produziert wurde.
1998 konzipierte und leitete er die von den Cortes de Aragón organisierte und gesponserte Gaspar Sanz Guitar Series, die fünf Jahre lang regelmäßig im Thronsaal des Aljafería-Palastes in Zaragoza stattfand und von Publikum und Kritikern sehr gelobt wurde.
Seit 1985 unterrichtet er am Conservatoire de Musique de Neuchâtel (Schweiz), am Conservatoire Superior de Cuenca und am J. R. Santa María Music Studio (Zaragoza). Er unterrichtete auch Vihuela, Barockgitarre, Basso continuo, Theorbe und romantische Gitarre am Internationalen Kurs für Alte Musik in Daroca und hielt zahlreiche internationale Seminare und Kurse in Saintes (Frankreich), Sardinien, Florenz, Rom, Verona, Urbino (Italien), in Jugoslawien sowie in Madrid, Granada und Cuenca.